Jan Haring nodigt Jommeke en zijn vrienden uit om samen op zoek te gaan naar de drietand van Neptunus. Een expeditie — waar ook professor Gobelijn deel van uitmaakt — is intussen op zoek naar het verzonken rijk Atlantis. In een Italiaanse haven lopen Jommeke en zijn vrienden Gobelijn tegen het lijf. Duikers vinden een gouden beker op de zeebodem en beweren dat ze Neptunus gezien hebben. Filiberke en Jan Haring trekken ’s nachts op onderzoek uit en zien een zeemeermin. Niemand gelooft hen. Overdag ziet Jommeke haar ook. Hij duikt haar achterna, maar zonder resultaat. Flip begint intussen te twijfelen aan het gedrag van een van de expeditieleden. Jan Haring wil nu absoluut als eerste Neptunus vinden. Op een rotseilandje in de buurt blijkt er iets aan de hand te zijn. Na onderzoek vinden ze vader en dochter Nikkel, expeditieleden, in een grot. Nicolas Nikkel blijkt het rijk van Atlantis gevonden te hebben. Samen met zijn dochter houdt hij de legende in leven om de expeditie op een dwaalspoor te brengen. De dochter speelt zeemeermin en een handlanger speelt Neptunus. Wanneer Choco de drietand neemt, begint de aarde te beven en verdwijnt Atlantis volledig. Jommeke en zijn vrienden kunnen zich nog net uit de grot redden. Jan Haring is tevreden, want hij heeft de drietand van Neptunus mogen aanschouwen.
